干細(xì)胞來(lái)源不盡相同，或胚胎，或胎兒，或成體各種組織器官。按照干細(xì)胞的來(lái)源，可將干細(xì)胞分為胚胎干細(xì)胞、胚胎生殖干細(xì)胞、成體干細(xì)胞3種。廣義的胚胎干細(xì)胞包括來(lái)自胚胎的胚胎干細(xì)胞和來(lái)自胎兒組織的胚胎生殖干細(xì)胞，狹義的胚胎干細(xì)胞僅指來(lái)自胚胎的胚胎干細(xì)胞。成體干細(xì)胞來(lái)自于成體各種組織器官，如造血干細(xì)胞、問(wèn)充質(zhì)干細(xì)胞、神經(jīng)干細(xì)胞、視網(wǎng)膜干細(xì)胞、表皮干細(xì)胞等。
干細(xì)胞存在于生命的各個(gè)階段，隨著生長(zhǎng)發(fā)育和機(jī)體衰老，干細(xì)胞的數(shù)量、分化潛能逐漸降低。一般來(lái)說(shuō)，隨著細(xì)胞分化程度增高，干細(xì)胞分裂能力逐漸降低，分化潛能變窄?；诖?，按細(xì)胞分化程度高低以及分化潛能大小，干細(xì)胞又可分為全能干細(xì)胞、多能干細(xì)胞和單能干細(xì)胞。
全能干細(xì)胞是一種未分化、分裂能力無(wú)限、具有發(fā)育全能性的細(xì)胞。它能分化出該種動(dòng)物所有類型的細(xì)胞、組織和器官，甚至生殖細(xì)胞，最終形成一個(gè)完整的個(gè)體。以人為例，每一個(gè)全能干細(xì)胞都具有形成完整個(gè)體的能力，在適當(dāng)條件下，每一個(gè)細(xì)胞都能發(fā)育成胎兒，形成個(gè)體。人的精子與卵子結(jié)合形成受精卵，從受精卵到桑椹胚的所有細(xì)胞均未分化，期間每一個(gè)細(xì)胞都具有發(fā)育成完整個(gè)體的潛能，都是全能干細(xì)胞。
多能干細(xì)胞是一種低度分化，分裂能力有限，不具有發(fā)育全能性的細(xì)胞。它能分化出該種動(dòng)物多種組織細(xì)胞，但不能發(fā)育為一個(gè)動(dòng)物個(gè)體，如能分化出紅細(xì)胞、血小板、B細(xì)胞、T細(xì)胞、吞噬細(xì)胞的造血干細(xì)胞；能分化出骨細(xì)胞、軟骨細(xì)胞、脂肪細(xì)胞的
間充質(zhì)干細(xì)胞；能分化出神經(jīng)細(xì)胞、星型膠質(zhì)細(xì)胞、少突膠質(zhì)細(xì)胞的神經(jīng)干細(xì)胞；能分化出精原細(xì)胞、精母細(xì)胞、精細(xì)胞的精原干細(xì)胞。
單能干細(xì)胞的分裂能力有限，分化潛能極為受限，能分化出該種動(dòng)物某一種類型或密切相關(guān)的兩種類型的細(xì)胞，不具有發(fā)育全能性。如只能分化出骨骼肌細(xì)胞的骨骼肌干細(xì)胞、只能分化出心肌細(xì)胞的心肌干細(xì)胞。
